醫(yī)院歷史可追溯至1888年英籍埃及人巴阿美（A. Falmy）在漳州創(chuàng)辦的福音醫(yī)院。1936年12月，英國倫敦公會、英國長老會、美國歸正宗教會、中華基督教閩南大會和中華基督教漳州區(qū)會，在福音醫(yī)院的基礎上合辦漳州協(xié)和醫(yī)院。1949年12月漳州協(xié)和醫(yī)院從馬公廟搬遷到漳州市醫(yī)院現址。1952年1月29日漳州協(xié)和醫(yī)院并入福建省第六專區(qū)人民醫(yī)院，醫(yī)院改稱為龍溪專區(qū)醫(yī)院（后稱龍溪地區(qū)醫(yī)院）。1986年改名漳州市醫(yī)院。

　　在市委、市政府的關心重視下，現已發(fā)展為醫(yī)療、教學、科研、預防、保健、康復和急救為一體的三級甲等綜合性公立醫(yī)院，是福建醫(yī)科大學非行政隸屬附屬醫(yī)院，也是華中科技大學同濟醫(yī)學院和福建中醫(yī)藥大學的教學醫(yī)院。2012年5月被確定為“衛(wèi)生部腦卒中篩查與防治基地醫(yī)院”，“福建省院士專家工作站”揭牌。擔負著漳州市轄區(qū)近500萬群眾的疑難重癥的搶救、醫(yī)療任務，被衛(wèi)生部授予“國際緊急救援中心網絡醫(yī)院”。

　　醫(yī)院占地面積78畝，建筑面積98865平方米，編制床位1056張，實際開放床位1407張，年門急診量148.6萬人次，住院量6.98萬人次，手術量3.17萬臺次。臨床醫(yī)技科室40個，病區(qū)28個，職能科室15個，附設漳州市腫瘤研究所及眼科中心。擁有13個福建省住院醫(yī)師規(guī)范化培訓基地，1個省級急診急救專科護士培訓基地。

　　醫(yī)院重視建設政治素質高、醫(yī)術精湛、醫(yī)德醫(yī)風好、結構合理的人才隊伍。全院職工2109人，其中，正、副主任醫(yī)師、福醫(yī)大兼職教授、副教授221人，高級技術職稱211人，中級技術職稱536人，碩士學歷169人，博士學歷6人。享受國務院政府特殊津貼1名，博士研究生導師1名，碩士研究生導師3名。

　　醫(yī)院注重學科建設和技術創(chuàng)新，大力引進和開展新技術、新項目，整體醫(yī)療水平顯著提高，形成院有重點、科有特色、人有專長的良好格局。血液科、腎內科、普外科、產科、骨科、泌尿外科、神經外科是本院的重點學科。腫瘤綜合治療、胸心外科、心血管內科、顯微外科、脊柱外科、神經科、婦產科、眼科、耳鼻喉科、口腔科、血液透析等專業(yè)在本地區(qū)處于領先地位。開展體外循環(huán)心臟不停跳心內直視手術、冠狀動脈搭橋術、冠狀動脈造影術、經皮冠狀動脈腔內成形術(PTCA)等心臟手術，自體肝移植手術，異基因造血干細胞移植術、自體造血干細胞移植術、射頻消融術、血漿置換術、新生兒重癥救治，以及腔鏡、微創(chuàng)、介入等高新技術項目達到省內外先進水平。近年來，獲福建省、漳州市科技進步獎65項，各級科研項目立項100余項。

　　擁有先進的飛利浦1.5T超導型磁共振2臺、64排螺旋CT 1臺、128層CT 1臺、SPECT/CT 1臺、大型心腦血管造影系統(tǒng)(DSA) 2臺，彩超、直線加速器、全自動生化分析儀、腹腔鏡、胸腔鏡、關節(jié)鏡、電子胃鏡、膠囊內鏡、超聲內鏡、數字乳腺攝影系統(tǒng)、口腔X線計算機體層攝影系統(tǒng)、光學相干斷層成像儀、高壓氧艙等大型先進設備和齊全的常規(guī)檢查設備，醫(yī)療設備總價值達4.37億元，為臨床診療水平的提高提供有力的保障。4個裝備良好的重癥監(jiān)護病房為急危重癥患者的搶救提供良好的條件。正在建設中的外科大樓占地面積3312.6平方米，總建筑面積54548.98平方米，設有800張床位。

　　醫(yī)院始終堅持“以病人為中心、以質量為核心”的服務宗旨，秉承“精誠博學、仁愛致遠”的院訓，不斷提高醫(yī)療質量和服務水平。先后榮獲“全國精神文明建設先進單位”、“全國文明單位”、“全國院務公開示范點”、“全國模范職工之家”、全國優(yōu)秀價格監(jiān)測定點單位、外科ICU榮獲“全國巾幗標兵崗”等多項榮譽。