衢州市婦幼保健院是一所二級甲等婦幼保健院，始建于1952年9月。醫院是浙江大學醫學院附屬兒童醫院衢州分院，是衢州市婦幼保健業務指導中心、產科急救管理中心、新生兒急救中心、新生兒疾病篩查管理中心，產前診斷中心、輔助生育中心。醫院現設6個病區，開放床位300張，現有職工近400人，衛技人員294人，其中高級職稱50余人。醫院婦產科暨生殖醫學科技創新團隊是市重點創新團隊，新生兒科為市級重點學科，產科、兒保科為市級重點建設學科，與上海復旦大學附屬婦產科醫院、浙江大學醫學院附屬兒童醫院、浙江大學醫學院附屬婦產科醫院合作，并建有兩個市級專家工作站，分別為浙江大學醫學院附屬兒童醫院杜立中院長兒科專家工作站和浙江大學醫學院附屬婦產科醫院林俊院長婦產科專家工作站。近五年來，醫院獲省部級立項課題1項，廳市級項目立項20余項，獲市廳級科技進步二等獎2項，三等獎6項。醫院現有碩士研究生導師1人，浙江省“151”人才1人，衢州市拔尖人才1人，衢州市名醫、專家5人，衢州市“115人才工程”第二、第三層次培養人員10余人。
醫院以“守護婦女兒童健康”為核心使命，實施“科教興院，特色發展”戰略，按照“做大婦科，做強兒科，做精產科，培育專科”的發展思路，致力于為全市婦女兒童提供提供優質高效、與社會經濟發展相適應的醫療保健服務。醫院學科優勢突出，專業特色鮮明。現設婦科、生殖內分泌科、產科、高危產科、兒科、新生兒科、婦女保健科、兒童保健科、外科、內科等專科。
婦科開設有婦科門診、宮頸疾病專科門診、不孕不育專科門診等，進行婦科各種疾病的診斷與治療，開展婦科腹腔鏡、宮腔鏡微創手術；應用宮腹腔鏡手術、藥物促排卵、人工授精等手段治療不孕不育癥取得良好的療效。我市首家生殖醫學中心于2012年12月通過評審，開展夫精人工授精技術。
產科是市級重點建設學科，具有一支技術過硬的搶救隊伍，對處理各種妊娠合并癥、并發癥、急危重癥以及疑難雜癥建立了規范流程，積累了寶貴的經驗。建立了孕產婦中央監護系統，對每個待產婦進行實時胎兒監護。開展無痛陪伴分娩、產后康復、新生兒游泳等特色服務項目。
兒科包括兒內科與新生兒科，其中新生兒科是市重點學科，建有市級專家工作站。新生兒監護中心是衢州市新生兒急救中心，擁有先進的醫療搶救設備和一流的專業醫務人員，年收治新生兒約1000余人次，年搶救危重新生兒約200余例。在早產兒、極低出生體重兒搶救方面積累了豐富的臨床經驗，有效地降低了衢州市新生兒死亡率。
小兒內分泌專科對小兒性早熟、矮小、肥胖及其他青春期發育異常兒童提供個體化的治療方案。并和浙江大學醫學院附屬兒童醫院長期協作，定期邀請兒童醫院著名專家、教授來院坐診。
婦女保健科以群體保健和個體婦女保健為主要職責。群體保健主要從事全市的婦女健康工作，包括全市孕產婦保健業務培訓、工作質量監督檢查，全市婦幼信息收集和資料分析。個體保健開設婚前孕前保健、孕期保健、更年期門診、婦女常見病普查等，同時開展優生優育咨詢和妊娠期高血壓疾病預測等特色服務。
兒童保健科是衢州市兒童保健技術指導中心、市級重點建設學科，承擔城區托幼機構衛生保健管理、兒童入園入托體檢、0-6歲兒童定期檢查、幼師健康證辦理、出生醫學證明管理等工作。本專科集兒童營養，兒童心理、認知與行為發育，新生兒疾病篩查等亞專業為一體，開展生長發育監測，新生兒疾病篩查，診斷性智力測定，兒童視力篩查和聽力篩查等業務。
目前，醫院正在按三級醫院進行規劃擴建，建成后占地面積52.87畝、擁有床位500張的新院區將為全市婦女兒童提供更為優質便捷的醫療保健服務。
