甲型流感病毒是根據病毒感染表層的紅細胞凝集素（H）和神經氨酸酶（N）來取名，在其中H有16個亞型，N有9個亞型。H5N6禽流感是禽流感病毒的一種亞型。
2017年11月17日，日本全羅道一家養鴨場出現H5N6亞型高高致病禽流感。該大農場有大概12000只家鴨，全部的家鴨過后都被屠宰。
H5N6禽流感病毒于2014年5月南充市在檢驗1例重癥肺炎病案咽拭子標本采集時，檢驗出H5N6禽流感病毒核酸陽型，經我國疾病防治監測中心進一步檢驗明確為H5N6禽流感病毒。
2014年5月，H5N6禽流感病毒病案是一名49歲的男士病人，有病亡禽畜觸碰史，住在南充市南部縣，疾病診斷為亞急性重癥肺炎，由省、市協同專家團全力以赴醫治無效身亡。
2014年12月22日，廣東省衛生計委從1例重癥肺炎病案中檢驗出H5N6禽流感病毒核酸陽型，我國疾病防治監測中心進一步核查檢驗結果為甲型H5N6禽流感病毒核酸陽型。病人為男士，58歲，現居廣州廣州番禺區，曾于2013年開展結腸癌手術，現階段病況危重癥，在廣州的定點醫療機構收治病人住院治療。1月中下旬，該病人被取得成功救護，轉到一般醫院病房。1月30日，全世界第一例H5N6流感活物病案取得成功救護情況報告會在廣醫一院舉辦。鐘南山在大會上強調，檢驗發覺H5N6病毒感染聚合酶627位點突變，非常容易感染人類；第一例取得成功救護個例確認，新型病毒要是盡早用奧司他韋等抗病毒治療，病案能冶療可救。
