直腸息肉是直腸良性腫瘤的一種，臨床上診斷的直腸息肉病例也是非常多的，由此可見，直腸息肉的形成原因也是大有不同的。大多數的直腸息肉都是因為飲食習慣或者生活習慣，同時遺傳也有可能。
(1)飲食因素：飲食因素與直腸息肉的形成有一定關系，特別是細菌和膽酸相互作用，可能是腺瘤性息肉形成的基礎。
(2)遺傳因素：一般認為，息肉形成與基因突變和遺傳因素有密切關系，從目前研究情況表明，突變基因可以由父母遺傳給后代子女，在遺傳機會上男女是均等的，沒有性別的差異。除了家族性息肉病或潰瘍性結腸炎惡變的引起的結直腸癌患者外，在其他結直腸癌患者中，約有5-10%的患者有明顯的家族腫瘤史，統稱為遺傳性非家族息肉病
(3)炎癥刺激：直腸粘膜長期被炎癥刺激；可引起腸粘膜的息肉生成，這是由于腸粘膜的炎癥充血水腫，糜爛潰瘍愈合之后，導致疤痕逐漸收縮，形成息肉狀，又由于慢性炎癥刺激，致腺體阻塞，粘液儲留而發病。息肉源于炎癥的稱炎性息肉；粘膜呈增生性改變的無蒂結節稱增生性息肉；由腸上皮生長的有腺瘤性息肉絨毛乳頭狀腺瘤息肉，此類息肉容易惡變。
(4)糞便、異物刺激和機械性損傷；糞便粗渣和異物長期刺激腸粘膜上皮，以及其它原因造成直腸粘膜損傷，使細胞出現異常增生，形成息肉。
