急性腦膜炎在通過治療以后，是會有后遺癥的，雖然經過一段時間的治療，患者仍然會有不同程度的肢體障礙、感到麻痹、吃東西困難等等的癥狀，這些癥狀都是很常見的，也不是每個患者治療后都會產生后遺癥，但是這些后遺癥也可以慢慢恢復。
能否得到最佳的恢復在于初發病后一次性治愈，若稍留有癥狀多會遲發腦病導致更嚴重的后遺癥。病毒性腦炎發病后西醫用激素蛋白治療可控病繼發更嚴重的損害腦神經，控病后神經不能恢復軾能的原因是受炎癥侵襲的神經仍出于麻痹不全狀態。
能否恢復在于及早的治療恢復神經功能才能早日康復。治療不當延誤治療受累神經會因缺血進間過久而遲發變性壞死。恢復無望。故能否恢復在于控病后的及早正確治療。治療方案：中藥營養神經增強改善受損神經微循環的血運，使受累麻痹不全的神經得到充分的血供預防繼發性缺血性受累神變性。并采用神經再生之藥興奮脊髓激活麻痹休克的神經獲得各種神經功能的改善恢復。需指導請發發病時和最近的磁共震和腦脊液檢驗單再次聯系。
急性腦炎（腦膜炎）等腦科急性病癥所造成的后遺癥目前還沒有什么好的或特別有效的治療方法，所稱的治療也多指那些康復性治療或鍛煉，并且需要很長的康復期才可能稍有效果，所以應該要堅持下去。
