本病需與銀屑病、扁平苔蘚、鮑溫病、假性上皮瘤樣增生、角化性棘皮瘤相鑒別。
1.銀屑病及扁平苔蘚 發生于龜頭上銀屑病及扁平苔蘚可呈紅色斑塊狀浸潤。但銀屑病多有多層銀白色鱗屑，剝除后有篩狀出血;扁平苔蘚發于龜頭者常呈環狀，伴有口腔黏膜損害。此外，在身體其他部位可見有銀屑病及扁平苔蘚損害。組織病理亦可鑒別。
2.鮑溫病(Bowen’s disease) 增殖紅斑與鮑溫病之間難以鑒別。有人認為本病系鮑溫病亞型。不同之處為鮑溫病除黏膜外，可發于各處皮膚，而本病則只限于黏膜或黏膜皮膚交界處。預后良好，惡變及轉移較少。
3.假性上皮瘤樣增生(pseudoepitheliomatous hyperplasia) 系由慢性肉芽腫或潰瘍等各種原因所致，組織病理可見表皮顯著肥厚呈不規則增殖，可侵入真皮深層。有多數核分裂，棘細胞通常分化良好，在表皮肥厚增殖的周圍可見炎癥細胞浸潤。
4.角化性棘皮瘤(keratoacanthoma) 多見于老年，好發于顏面、耳郭及手背等暴露部位，皮損通常為單發的豌豆至蠶豆大孤立性半球狀隆起。質硬，境界清晰。頂端可形成火山口狀凹陷，充填角栓。生長迅速，吸收后遺留萎縮性瘢痕。
組織病理：表皮增殖明顯，可侵入真皮，增殖的棘細胞可見多數核分裂，真皮水腫，有淋巴細胞、嗜酸性細胞、顆粒細胞及少數漿細胞浸潤。
