手足口病鑒別
根據臨床特征，在大規模流行時，診斷不困難，但散在發生時，須與下列疾病相鑒別：
(1)與皰疹性口炎相鑒別
四季均可發病，以散在為主。一般無皮疹，偶爾在下腹部可出現皰疹。起病時可有38℃-40℃的發熱;1-2天后口腔黏膜上出現小水皰，可為單個，也可成簇;小水皰破潰后形成很淺的潰瘍，上面有黃白色膜樣滲出物，周圍有紅暈;患兒常有局部疼痛伴流涎，煩躁哭鬧、拒食吐奶等表現，通常1到2周即可消退。
高發群體
皰疹性口炎是Ⅰ型單純皰疹病毒引起的急性感染，以6個月到2歲的嬰幼兒最易患病。
若不經治療，經過l-2周會自愈，但容易復發，如果寶寶反復發作，通常與微量元素鋅的缺乏有關。
高發季節
皰疹性口炎終年可以發生，冬季為流行高峰，且具傳染性，可在幼兒園等群體發病。
(2)與口蹄疫相鑒別
口蹄疫的病原體為口蹄疫病毒，屬于人畜共患病原體。手足口病是由數種腸道病毒感染所致。口蹄疫病毒只引起偶蹄類動物牛、羊、豬、鹿、駱駝等發生口蹄疫，成為人患口蹄疫的傳染源。只有先出現獸疫，才有可能使人患病。口蹄疫是通過接觸病畜口腔、蹄冠部的潰瘍爛斑，經皮膚粘膜感染的;偶而也有食用了被病毒傳染而又未加熱(巴氏消毒)的奶感染的。因此，人患口蹄疫是極為散在發生的。手足口病是由于接觸病人，通過日常生活用品、食具、玩具的污染經口感染的，也可通過呼吸道傳播。口蹄疫、手足口病雖患病部位在口腔、手指間、足趾端有相似之處，但癥狀體征各有不同。
口蹄疫起病后主要表現為全身中毒癥狀和局部皰疹損害兩大特征。出現發熱、頭痛、全身不適，1~2天后在口腔粘膜、舌邊、手指間、足趾端發生水皰，再1~2天水泡破潰，形成爛斑，繼發感染成膿皰，然后結痂、脫落，一般不留瘢痕。手足口病大多無發熱或低熱，但有呼吸道感染癥狀。先在口腔粘臘出現皰疹，分布和頰粘膜、齒齦、舌邊，并破潰成潰瘍。隨即在手指、足部、臀部、膝部出現丘疹，第二天只有少部分丘疹形成皰疹，如綠豆、赤小豆大，單個性不融合，內含透明液體，終不破潰，3~5天自行吸收收縮。
(3)皰疹性咽頰炎
可由CoxA組病毒引起，病變在口腔后部;如咽前柱、扁桃體、軟腭、懸雍垂，很少累及頰粘膜、舌、齦。可通過檢測EV71確診。
(4)水痘與手足口病之五大鑒別
小兒手足口病的發病與水痘類似，皮疹也有相似之處，有時容易混淆不清。兩者之間還是具有很多不同點，鑒別如下：
易感人群的區別：手足口病的患兒，通常以3歲以下的寶寶最為多見，其次是3-5歲的寶寶;而水痘患兒1-6歲均可多見。
病原體的區別：手足口病是由腸道病中的柯薩奇16病毒引發，好發于每年的4-5月，6-7月份是發病的最高峰，8月份開始下降，9月份以后就很少見了，因此小兒手足口病的發病很有季節性;而水痘是由水痘病毒引起的一種急性傳染病，主要發病季節是在冬春，夏季較少見。
皮疹的區別：小兒手足口病患兒的皮疹主要出現在口腔黏膜、手和腳部，尤其是口腔黏膜多數都出疹子，同時伴發口炎或口腔潰瘍的也較多;而水痘的皮疹呈向心性分布，即軀干處較多，四肢、頭面部少，手心、腳心及口腔黏膜上的疹子更是少見。
有無免疫力的區別：小兒手足口病患病痊愈后，不會獲得免疫力;而嬰幼兒患過一次水痘，病愈后即可獲得永久性的免疫。
其他區別：正在使用激素的寶寶與小兒手足口病的患兒接觸，不會病情加重;而與水痘患兒接觸，則會使他們的病情很快加劇。
(5)與其他病毒所致腦炎或腦膜炎相鑒別
臨床表現與手口足病合并中樞神經系統損害的重癥病例表現相似;
(6)與脊髓灰質炎相鑒別
主要表現為雙峰熱，病程第二周退熱前或退熱過程中出現弛緩性癱瘓，無皮疹;
(7)與肺炎相鑒別
表現為發熱，咳嗽，呼吸急促等呼吸道癥狀，一般無皮疹，無粉紅色或血性泡沫痰;
(8)與暴發性心肌炎相鑒別
一般無皮疹，有嚴重的心律失常、心源性休克、阿斯綜合征發作表現。
