本病預后一般較好，許多病人并無癥狀且有些壽命如常人，但未閉動脈導管粗大者可發生心力衰竭，肺動脈高壓而發生右至左分流者預后均差，個別病人肺動脈或未閉動脈導管破裂出血可迅速死亡，嚴重者嬰兒期經常肺炎，心衰，久之可引致肺動脈高壓，梗阻型肺血管病，甚至出現血流自肺動脈流入主動脈(稱艾森曼格綜合征)。
本病主要的一些手術并發癥，包括以下幾種：
1、術中大出血：
最嚴重且常導致死亡的意外事故，發生大出血的破口較隱蔽，通常在導管后壁或上角，出現大出血，手術醫師應保持鎮靜，迅速用手指按壓出血部位，暫時止血后，吸凈手術野血液，若降主動脈已先游離(切忌亂下鉗夾)，可牽起條帶，用兩把動脈鉗阻斷主動脈上下血流，同時鉗夾導管，然后切斷導管，尋找出血破El，再連同切端一并用3—0或4—0無創傷聚丙烯縫線作連續或8字形間斷縫合，如降主動脈未先游離，用示指按壓暫時止血后，立即肝素化，緊急建立體外循環，分別在左鎖骨下動脈根部和降主動脈或左股動脈插入動脈供血管，切開心包于右心耳或右心室流出道插入靜脈引流管，迅速建立轉流，并行血液降溫，然后游離導管鄰近的降主動脈，鉗夾降主動脈的導籬，切斷縫合導管和裂口。
2、左喉返神經麻痹：
術后聲音嘶啞的原因，除氣管插管引起喉頭聲帶水腫外：主要是術中牽拉，引起左喉返神經水腫，或結扎切縫導管時損傷神經.，致術后早期進水或流質時嗆咳，聲音沙啞，經潑尼松，維生素B1和B6 以及理療等治療，水腫可于2～3周內消退恢復，神經損傷后聲的關閉雖可由右側聲帶移位代償，使進食不致嗆咳，但聲音低沉沙啞則為永久性。
3、導管再通：
一般發生于導管結扎術后，主要由于結扎管腔不夠禁閉，或結扎線松脫，或因結扎線撕裂導管內膜，并發假隆動脈瘤，瘤內破裂而再通，發生率約在2%，臨床上在術后早期或若干時日后又聽到典型的心雜音，彩超證實主，肺動脈間有分流，過去多采用直接切斷縫閉法治療，由于導管周圍有瘢痕組織，粘連緊密，游離導管困難，易引起破裂，故需冒較大手術風險，目前導管再通的處理有兩種較妥當的方法：一是導管填塞術，簡便易行，是首選的方法;二是深低溫體外循環下經肺動脈縫閉導管開口，手術雖較復雜但比較安全，詳見后。
4、假性動脈瘤：
這是極嚴重的并發癥，由局部感染或手術損傷導管所造成，臨床表現為術后2周發熱不退，出現聲音嘶啞或咯血，左前胸上方可有雜音，胸部放射線攝片示肺動脈段突出呈現塊狀陰影，確診后應盡單手術，以防突然破裂大出血致死j手術應在體外循環下進行，可參照體外循環導管處理法，主動脈切端可直接縫合或用人造織物補片修補，或行人造血管移植術。
5、乳糜胸：
很少見，主要因解剖主動脈弓降部和左鎖骨下動脈根部損傷胸導管，術后早期發現;當再次進胸，在上述部位找到乳糜漏出口予以縫扎，較晚發現，則行保守療法，如不奏效，再剖右下胸，在膈肌上半奇靜脈旁縫扎胸導管。
